設立天文及天文物理研究所籌備處
評議會通過設立天文及天文物理研究所籌備處（1993年4月總統核可）。
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天文及天文物理研究所
中研院與臺灣大學簽訂學術合作協議書
中研院與臺大為促成跨機構研究上的合作及相互激盪，達到學術上的卓越並兼及研究資原共享之前瞻性意圖，雙方在2000年6月簽訂「合建天文物理與數學館協議書」，興建中研院數學所、天文所及臺大天文物理所、數學系共用之研究大樓。
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宇宙微波背景輻射陣列正式啟用
天文所籌備處與臺大合作進行宇宙微波背景輻射陣列計畫，在美國夏威夷毛納基峰興建世界級天文設施，於2006年10月3日舉辦啟用典禮，並正式命名為「李遠哲陣列」，是亞洲首座且僅有的一座專門研究宇宙學的儀器。（照片提供：天文所）
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海王星外自動掩星普查計畫
由本院天文及天文物理研究所、墨西哥國立自治大學及美國史密松天文臺合作興建的「海王星外自動掩星普查計畫」(簡稱TAOS-2)，已於墨西哥時間5月2日下午，於墨西哥聖白多祿國家天文臺舉行破土典禮。這項計畫由本院主導，將建置三座口徑1.3米寬的自動望遠鏡，每座望遠鏡將配備最新技術研發的高速高感度相機，對位於太陽系外圍區域的小天體所造成的掩星事件進行長時間的觀測。這是臺灣與墨西哥之間第一次大型的科學合作。
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