史語所臺灣考古館後棟於1968年起分期增建完成，2008年，為改善後棟館舍安全及環境品質，進行改建，於2012年7月竣工啟用，為地上三層、地下一層之建物，標本整理及庫藏之空間已獲改善。外牆上的標誌以史語所發掘之十三行遺址出土具代表性文物─金飾鳥紋圖 像為主要入口意象，以黃色為底，進行剪影式藝術性設計表現，讓線性粗細變化的韻律與造形的組合，兼具明亮層次變化的美感，引領進入大樓中庭空間。
