1999年921大地震之後，近美大樓部分結構系統出現裂縫，安全堪慮，遂決定將參考閱覽室及圖書館暫遷檔案館一樓大型會議室，工作人員也移至檔案館作業。之後院方委託臺灣營建研究院進行大樓結構安全評估，認為經過補強修繕，尚可續用30年，遂在獲得外界捐款之後，輾轉委請潤陽營造股份有限公司承包，2001年1月峻工，郭廷以圖書館遷回原址。
